・３年前（４年前）の情報爆発（憂鬱）
・映画を完成させた人物（ゲームでは時間遡行したキョン）（溜息）
・朝比奈ミクルの冒険 Episode00（動揺）
・一時的に谷口の彼女だった光陽園女子（消失）
・古泉「弱まっている可能性があるんですよ。涼宮さんの力。それから長門さんの情報操作能力もです」（暴走P261、雪山）
・古泉「僕は一度だけ『機関』を裏切ってあなたに味方します」（暴走P307、雪山）
・古泉「僕が記憶喪失になってもだいじょうぶそうですね」（陰謀P275）
・みくる「（藤原は）そんなに悪い人には見えなかったの」（陰謀P300）
・藤原のみくる（大）への敵意（陰謀）
・みくる（大）「近いうちに、もっと大きな分岐点がやってきます」（陰謀P394）
・鶴屋「未来人か宇宙人だったら、どっちがいい？」（陰謀P405）
・鶴屋山から出てきた謎のオーパーツ（陰謀）
・長門の小説（憤慨、編集長）
・モノローグ「記憶を失いでもしない限り、な」（憤慨P162、編集長）
・モノローグ「もし、ハルヒの無意識が時間を遡ってそんな過去にまで作用するようなものなんだったとしたら、
かなりの勢いで話がぶっ飛びすぎている。だが、朝比奈さん……未来人がこの時代に来ているということは――」（憤慨P285、WS）
・シャミセンに凍結、保存された情報生命素子（憤慨、WS）
・キョンは春休みに道中で偶然ミヨキチに会った。（分裂P62）
・モノローグ「俺は思う。SOS団に正規の団員はこれ以上増えないだろう、と。
（中略）結果として、その俺の予感は文字通りに半分当たりで、半分は外れることになる」（分裂P99、100）
・モノローグ「あんなにややこしいことが発生するとは誰にも予想外だっただろう。（中略）涼宮ハルヒが、それをしたんだ――」（分裂P100）
・九曜「――今度は…………間違えない――――あなたが…………それ」（分裂P131）
・わたぁし「あたしもこんな妹（キョンの妹）が欲しかった」（分裂P156、α）
・モノローグ「（『わたぁし』の口調について）聞き覚えはさらさらないが、イントネーションが誰かに似ている。
普段はこんな声を出さないであろう人間が、この声を演じているような感覚だ。（中略）ただ、どことなく妹に通じる幼い口調だ、とだけ」（分裂P156、α）
・ハルヒ「（所望する新入部員は）あたしが全然思いつかなかったような（中略）まったく新種のオリジナルな個性の持ち主」（分裂P270、α）
・長門「現時点における（天蓋領域の）危険性は低い。無視できるレベル」（分裂P168、β）
・藤原「（時空改変等の）力が存在するなら、それが誰にあろうと関係ないんだ」（分裂P198、β）
・モノローグ「（喫茶店に）残った佐々木と藤原が何を話したのかは知らない。知りたいとも思わなかった。この時には」（分裂P218、β）
・モノローグ「（授業中に見た夢、中３の佐々木との会話の中で）なんだか重要なセリフを聞いたような気がするんだが」（分裂P244、β）
・国木田「（佐々木は）意識的に変な部分を演じているんじゃないかと思うな」（分裂P247、β）
・みくる「（藤原は）悪いことをするために来たんじゃないと思います」（分裂P276、β）
・みくる「TPDDによる時間移動は……そうですね、時間平面に痕跡を残すので……」（分裂P277、β）
・モノローグ「（長門が倒れたことを受けて）俺の持つ切り札。ジョーカーを表向きに置くのは、今、この時なのか」（分裂P294、β）
・ハルヒが作っている入団試験の筆記試験（分裂）
