青之六号在日本动画技术史上的里程碑意义，早已是公认的事实了，但这也导致对其画面的过分关注而忽视了情节，至于全片的主题，一般的说法就是“环保”。
保护环境自然意味着对工业文明的反思，故事中变异海洋生物对人类领地的大举侵犯，看上去除了有点矫枉过正之外，貌似也正是在暗喻自然对人类的惩罚——可惜这只是青六最表面的含义。
还是先从人物形象上谈起，鱼人妙迪奥是很受观众欢迎的女性角色，温柔可爱而又通情达理，很容易让人联想到传统的“大和抚子”；那头帮助主角名叫“赤秃”的姆斯加，语气中透露出智慧的老人形象，它的死亡颇具日本式的宿命感；鲨鱼人比路古，作为指挥官相当残暴，但是在达尔古这个“父亲”面前，它又表现出思想单纯人格不独立的另一面，极重的父权崇拜情结。
再来看人类一方就更有意思了，纪之真弓很有代表性，她的家园被海洋入侵者所毁灭，所以她整日念叨的便是刻骨铭心的战争创伤，为了复仇她可以说是累死累活的“工作狂”，集体主义思想浓烈个人生活趣味迹近于无，她的想法无非是“团结起来动员大家做好XX建设”，现代工业化运动的典型思维。
男主角速水铁则完全不同，他坚持与集体格格不入的个人主义，一脸摇滚青年似的颓废相更是明显的后现代征兆，于人于事常常显得很冷漠，但是比起纪之真弓这类人来说，他有着超越种族的视野，更具宽容心和同情心。
分析到这里不难看出，青之六号在设定上黏附着奇特的现实色彩，隐隐约约是将二战前后直至当时（九十年代末），旧日本新日本新新日本的不同因素影射了一遍——双方的武器可以进一步提供证据：青之六号属于后现代高科技，核弹的现代性不必多说，幽灵战舰则明显是“大舰巨炮主义”的产物，在上面手持军刀耀武扬威的鲨鱼人比路古，对“父亲”达尔古的崇拜类似于天皇崇拜，反过来达尔古对主角的一些话又透露出他已不能真正控制这群崇拜者，战争实际上由达尔古一伙在推动，就像日本下层军官挑起侵略战争的说法一样？！
显然海洋变异生物一方并不是作品中的负面角色，相反那个与青总部共赴黄泉的指挥官才是全剧最单调呆板的人物，而当主角一行终于进入到神秘的南极基地时，才发现这里居然是一个“世外桃源”似的和平小岛……
原始自然而又和谐自治的古朴村落，可谓日本人的一种心结了，青六中的这个场景带有两方面的色彩：一是与世隔绝异常封闭，二是面临着被核武器毁灭的危险。联系到原作诞生的20世纪60年代，那不正是美苏争霸的高潮时期么？战后刚解除武装的日本正好夹在中间。日本人在战争阴影下的自我投射和关照，在青六中出现很正常毫不奇怪。
作为近四十年之后的改编作品，青六OVA无疑又染上了新的时代色彩，与科波拉的《现代启示录》一比，容易发现其中存在着颇为类似的地方。其实两者的故事框架基本相同，开头也是如出一辙，被战争搞得颓废抑郁的男主角，被再次征召去执行一项事关重大的特别使命，秘密潜入到某个与世隔绝的神秘王国，杀掉某个原是我方精英但却离经叛道，在那边占据统治地位的，精神不正常的怪异人物。
如此看来，动画对达尔古的形象塑造，模仿《现代启示录》中科茨上校的痕迹再明显不过了，都是文明人成了原始部落的主宰，都是那么孤独而又神秘，动不动来几句诗歌，对世界都感到异常地绝望，最终都可以说是借他人之手自行了断（青六里并未明确说明），科茨上校的被杀，达尔古的海葬，都采用了象征化的表现手法，宗教仪式味极其浓重。
两者采用的模式基本相同，但是填充的文化内涵却大不一样。青之六号里反复引用的是《万叶集》，“岩石旁的我被群生所拒，惟家中白煮与薯在伫候，战战兢兢地伫候着的你，也许在混在石川之水中”，作为日本现存最早的诗歌总集，此处很明显地表达了回归自然的生活态度，这一点就同前面所说的“环保”联系起来——保护环境也好回归自然也好，表面上是对“人类工业文明”的反思，但是考虑到工业革命正是起源于西方，相对地引用日本古诗来宣扬环保，背后所持的文化立场一目了然。
最终我们不难发现，对于青之六号来说，环保更多的只是立论根据，还有表层掩饰功能，故事真正的主题，除了张扬一定的日本主体性外，最重要的仍然要归结到人与人，文明与文明之间的相互交流，相互理解以致和平共处上来。前面已经说过，这是部有着明显冷战阴影的片子，两大阵营对立导致全球毁灭的设定，正是那个年代人类危机的写照，出现在当时很多文艺作品之中。青之六号的结尾并未达到和平的境地，但却有关键性的转折——不同文明之间从此建立了沟通的桥梁，因为起先的对抗就如同《世界之战》中的火星人入侵地球，相互之间无任何谈话只是纯粹的恐惧，而现在有了初步的相互交流，所以说这是一个巨大的飞跃，意味着从此打破了封闭的种族壁垒——以自闭症候著称的日本人，常常有这样的呼声，同时这也是全世界和平主义者的心声。
花絮：
1、速水铁和妙迪奥之间有条隐藏的恋爱线索，牵涉到人类与非人类的婚配问题，从这一点挖掘下去显然有违作品的本意，因此这场恋爱注定是谈不成的。故事的最后，纪之真弓陪着速水铁坐在岸边，妙迪奥安抚着鲨鱼人潜入海底，暗示出两对情侣关系，透着一股淡淡地哀伤。
2、本人不得不承认，至今尚未看过原作，因此文中的一些观点只能算是合理推断。不过对于OVA版的创作人员来说，没看过《现代启示录》的可能性极小，这部科波拉于1979年拍摄的经典实在是太有名了。然而《现代启示录》同样是由名著改编而来，康拉德于1899年12月出版的《黑暗之心》。因此原作者创作《青之六号》的时候不可能看过《现代启示录》，但却有可能看过《黑暗之心》，两部作品原作与改编这四者之间错综复杂的关系，还真是难以索解。
